L'expertise scientifique peut se décliner sous forme d'avis, d'examens ou encore d'évaluation rendue par un ou plusieurs experts à la demande d'une institution pour permettre une prise de décision.
L'équipe POEPA répond aux demandes d'expertise des gestionnaires de la pêcherie australe française (TAAF, Réserve Nationale Naturelle) et aux administrations centrales (Direction de la Pêche Maritime et de l’Aquaculture du Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation).
Elle est aussi partie prenante des commissions internationales CCAMLR et APSOI et participe aux Conseils scientifiques de ces organisation en tant qu'experts français.
L'équipe répond également aux demandes des armements pour l'examen annuel de la certification de pêcherie durable.